A Duna közelében, az aquincumi romkert szomszédságában épült fel iskolánk 1984-ben. 1985 tavaszán került részleges, majd az év folyamán teljes átadásra. Kapuit 1985. március 11-én nyitotta meg. Beiskolázási területünk a Szentendrei út - Pók utca - Nánási út - Monostori út által határolt "négyszög" valamint a Gázgyári lakótelep lett. Az 1985/86-os tanévben 300 tanulóval 30 pedagógus foglalkozott 1-7 évfolyamon. A lakótelep folyamatos benépesülésével a tanulók létszáma tanévről tanévre emelkedett.

Az iskolánk előtti teret Dr. Arató Emilről, a szegények orvosáról nevezték el. A névadó ünnepségre 1986. november 15-én, születésének 100. évfordulója alkalmából került sor, amelyen Marosi Ilona festőművész Napmadár című grafittója is átadásra került, mely tornatermünk külső falát díszíti. Ezen ünnepélyes alkalomból iskolánk felvette Arató Emil nevét.

• 1986-ban 3. osztálytól emelt szintű angol nyelvoktatást, 1989-ben pedig emelt szintű matematikatanítást indítottunk 5. évfolyamtól.

• 1988-ban 8 tanteremmel bővült iskolánk épülete.

• Az 1989/90-es tanévtől a Duna közelségét, valamint a Sportlétesítmények Vállalat és az "R"...SE szakmai közreműködését és eszközállományát felhasználva biztosítottuk felsős tanulóink részére testnevelés órákon a kajak-kenu sportág ismereteinek elsajátítását.

• Az 1990/91-es tanévtől technika órán számítógépes alapismeretek oktatásába kezdtünk.

• Az 1992/93-as tanévben tetőzött a tanulói létszám, az 1230 tanulót 96 pedagógus tanította.

• Az 1993/94-es tanévtől a kerületi Népzenei Iskola támogatásával népi gyermekjátékok oktatására nyílt lehetőség, s ugyanebben a tanévben indult az Aelia Sabina Zeneiskola közreműködésével zenei irányultságú osztály.

• 1997-ben elkészült az iskola első pedagógiai programja.

• Az 1999/2000. tanévben iskolánk 8 tantermébe költözött a Kalászi Úti Általános Iskola felső tagozata, mely a következő tanévtől iskolánkba olvadt.

• 2000 őszétől a Platán Könyvtár működik épületünkben.

• 2002-től az épület egyik szárnyában a kerületi Iskola Pszichológus Hálózat kapott helyet.

• 2008/2009-es tanévben általános tantervű, és magyar-angol két tanítási nyelvű osztályokat indítottunk.